Au début des années 2000, le corps électoral de la Commune Les Bois a décidé de remplacer l’assemblée communale par l’instauration d’un Conseil général. Ainsi, la Commune Les Bois est la 4^ème du Canton du Jura à posséder un parlement. Le premier Conseil général fut élu pour la législature 2001 – 2004. Le Conseil général des Bois comprend 21 membres. Pour la législature en cours, cinq partis politiques y sont représentés avec la répartition suivante des sièges : 5 PDC, 5 Liste libre, 5 PS/Les Verts, 4 PCSI et 2 UDC.